藏密的神主要有大日如来、金刚持、大威德怖畏金刚、胜乐金刚、密集金刚、时轮金刚、欢喜金刚、马头金刚、大黑天、吉祥天母、金刚亥母、墓葬主等。
藏密的神主要有：
（1）大日如来。它是藏密崇奉的最高最主要的本尊，梵名谓之摩诃毗卢遮那。“摩诃”意为大，“毗卢遮那”为日之别名，故译为大日。又毗卢遮那为光明遍照之义，故又称遍照如来。藏密视大日如来为理智不二的法身佛，是尊奉的主要对象。其像在密宗殿居最中央位置。其形象类似于释迦牟尼的坐像。
（2）金刚持。梵文为Vajradhara，音译为“伐析罗陀罗”，“伐析罗”即金刚杵，“陀罗”是持、执义，故亦译为“持金刚”，“执金刚”，密宗菩萨名。《元史》据藏文音译为“朵儿只唱”。身呈青金色，右手持金刚杵，左手执金刚铃，表示金刚部菩萨摧毁魔敌之坚毅智力；金刚杵也表示如来金刚智印。藏密谓释迦牟尼讲说密法时所现身相，故为密宗的秘密主。
（3）大威德怖畏金刚。藏传佛教密宗菩萨名。密宗教法讲：“有伏恶之势，谓之大威；有护善之功，谓之大德。”大威德怖畏金刚即藏密五大明王或金刚中之大威德明王。形象为三面六臂六足，乘大白牛。梵名作阎曼德迦，别称降阎魔尊、六足尊、六臂金刚等。藏密认为此尊系无量寿佛的忿怒身，以其可怖可畏的相貌去教令法界降伏妖魔。文殊菩萨化身之威德怖畏金刚，为藏密无上瑜伽宝生部三本尊。其像为九头，正面为牛头，三十四臂、十六足、裸体、拥抱明妃罗浪杂娃，身色蓝或黄，头上有炽热火焰，头顶无量寿佛，足踏卧鹿等，手执盛向之头盖骨碗（藏语戛巴拉），有的像下踏一牛，牛下卧一男人体。为西藏佛教格鲁派密宗所修本尊之一，被视为该派护法神。
（4）胜乐金刚。又作上乐金刚，藏名德巧，为藏密本尊之一。拉萨藏密修习机构举麦巴扎仓（下密院）极重视此本尊之法的修习，为修无上瑜伽密之本尊。其像有四面脸，分为白、黄、红、蓝各色，每脸有三目。有十二臂，主臂拥抱明妃金刚亥母，裸体，两腿，右脚踏一伏首趴身的恐怖男者，左脚踏一仰面躺身的女者。藏传佛教噶举派多修此本尊之法。
（5）密集金刚。亦称“集密金刚”，藏传佛教密宗本尊之一。藏名为“桑堆”。其像三面，每面有三目，六臂，拥抱的明妃也是六臂，身深蓝，呈坐式。
（6）时轮金刚。藏密本尊之一，藏名“堆柯”。系时轮金刚密法之本尊。藏密认为，时轮金刚密法源于古印度北方的“香巴拉国”（谓该地如同极乐世界），大约于12世纪传入西藏。时轮金刚密法确认一切众生都在过去、现在、未来“三时”的“迷界”之中。并以时轮表示“三时”。宣扬释迦牟尼之上还有一个“本初佛”，此佛为一切事物的根本源泉。还提倡修习此法应控制体内的“有生命的风”，以保长寿，并通过所谓“五智”和“禅那”合一相应法，去追求“即身成佛”。其形象有多种，均为双尊像，有单头的、五头的，双臂的、多臂的，脚下踏入，表降伏意。
（7）欢喜金刚。藏名“杰巴多吉”，又称饮血金刚。双尊置莲花座上。明王八面十六臂，主臂拥抱明妃“金刚无我佛母”，其皆手托头器，内盛神物，右手托物为白象、青鹿、青驴、红牛、灰驼、红人、青狮、赤猫。左手托物为黄天地、白水神、红火神、青风神、白日天、青狱帝、黄施财。胯下挂骷髅，足踏二仰卧人，表示明王盛猛。明妃一面二臂，右手执曲刀，左手托头器，头戴五骷髅冠，项挂50骷髅链圈，象征梵文的50个字母。
（8）马头金刚。又称作马头明王、马头观音、马头观音自在，藏名为“丹真”，为藏密胎藏界观音院之本尊，系六观音之一，畜生道之教主。藏密认为是无量寿佛的忿怒身，以马头为头饰，表示有大忿怒和威猛摧伏之势。如宝马驰骋四方和涉生死海，摧伏一切邪魔，食一切无明重障。其身赤肉色，三面，双身外露，背有威猛光焰。其拥抱之明妃为“多罗菩萨”。
形象有多种，像有多种，有八头的、六头的、有翅膀的。格鲁派只崇拜前两种，后者为宁玛派所崇拜。黄教上、下密院把此尊作为护法神之一。
（9）大黑天。藏密护法神之一，梵文为“摩诃迦罗”，藏语称为“玛哈噶拉”，为大自在天或滚波朱巴的化身。青色三面六臂，前左右手横执剑，中间左手执人头，右手执羊，后左右手执象皮，张于背后，以骷髅为璎珞，据云：大黑天为战神，礼祀此神，可增威德，举事能胜。西藏民间又视其为施福之神，每于香火，必将饮食供之。藏密说此尊系大日如来为降伏恶魔而显之形象。
（10）吉祥天母。当我们参观西藏佛教寺庙时，常见到一尊身骑黄骡的极凶丑的神像，她就是吉祥天母。藏语叫“班达拉姆”。她的名字有100个，每个名字都有一个像。一般是两个像：一是和平像，一是威猛像，两个像合起来叫班达拉姆。威猛像骑黄骡，骡的屁股上有一只眼睛。藏族信徒认为供奉她可以除灾难，使人丁兴旺。藏传佛教信徒相信，每年正月初一日她骑着太阳光周游全世界，这一天太阳光在她肚子里，所以人们在这一天要供奉祭祀她。她的嘴上叼着死尸，来表示经常吃人。她的像前后一般有长着鳄鱼头和狮子头的两个女性，据说是她的两个妹妹。从前，藏族青年男女很尊崇她，认为她能给人以智慧与幸福。她又称为“三界荣耀女王”，系众神之首，众佛之母。她是原西藏地方政府的保护神。
（11）金刚亥母。藏名为“多吉帕姆”，意为金刚母猪。藏传佛教密宗本尊神。头现猪形，女身，为胜乐金刚的明妃，其像为与胜乐金刚相抱之形，其身有的呈红色，有的呈黄色，有八只臂的，诸手执各种法器；有两臂的，手无执物。该尊为藏传佛教噶举派修密法的本尊。
（12）墓葬主。在西藏寺庙的壁画上常见到两具骷髅的像，一手执天杖，一手托头器，头戴五骷髅冠。此为藏密胜乐金刚的护法神。因藏密以两具骷髅表示墓场的主神，而此神居住在天葬场维护佛教，故称“墓葬主”。其背后有熊熊火焰。