关于密宗义理,西藏佛教各派密法各有侧重,宁玛派以大圆满法为主;噶当派以阿底峡的《灯论》为宗旨,讲「三士道」修法,倡显密圆融;萨迦派以「道果法」为主;噶举派以大手印为主;格鲁派的密法和噶当派大体相同。
另外,各派密法修习者修哪一部密法、本尊,又有自己的抉择,种类繁多。但各派密法大体均属于印度密教金刚乘和时轮教的范围之内。各派密宗教义也以《大毗卢遮那成佛神变加持经》即《大日经》、《金刚顶经》和《时轮金附根本经》为主要依据。
密宗自称受法身佛大日如来深秘密教旨传授,为真实言教。其实,密宗教义的产生、形成均有其社会历史根源。
密宗义理主要者可概括为“三密为用”、“四曼为相”、“五佛五智”、“六大为体”及“因、根、究竟”等。