印度著名密教寺院是在波罗王朝时期发展起来的。那烂陀寺本来是大乘显宗寺院，后来发展成为显密兼修的著名寺院。

那烂陀意为“荷花”，那烂陀寺是古印度历史上最大的佛教寺院，曾有多达九百万卷的藏书，历代学者辈出，最盛时有万余僧人学者聚集于此。

中国唐代僧人义净记载，他曾在那烂陀寺多次入坛修密，说明当时该寺已经风行密教。

欧丹多富梨也是印度著名的密教寺院。波罗王朝四世达摩波罗时，国力最盛，该寺就是他主持修建的。地点在那烂陀附近。达摩波罗王为了利用宗教，又在恒河南岸的小山上另建一座寺院。寺院是以王的另一尊号命名的，称作毗鸠罗摩尸罗，汉译名超戒寺。此寺遗迹，今已荡然无存。据西藏史料记载，规模比那烂陀寺还大，中心是一个大菩提佛殿，四周围绕有108座小寺院，其中有一半属于密教的内道部分（密教也分层次，有内外之别，高级的属于核心部分的叫内道），另一半属于密教的外道部分和显宗。

由此可见，该寺以密教为中心。寺内墙壁上绘画了主持该寺的著名学者的图像。住寺学者，经常有108人，执事有114人。在寺院学习毕业时，国王给成绩优秀者以“班底达”（学者）学位称号。特别有成就的学者称作“守门师”，后世有“六贤门”（六门指东南西北四门和中央两道门）之称。毗鸠罗摩尸罗寺以密教为主，当然更适应群众的信仰。以密教为方向提倡佛学，对统治者也有利，所以波罗王朝各代对它均予以大力支持，一直存在到斯那王朝时期。